Ну сквозные дыры я бы не советовал горелкой......
Я думал у АКБ сверху трещины..., а дыры.....

даже и не знаю.
По личному опыту скажу, заплавлял горелкой трещины на верхней крышке, в той, которая "лабиринт". Перетянул крепежной планкой АКБ.
Дыры - тут другой подход наверное нужен.
Не встречал я пока клея, который хорошо клеит полиэтилен, а тем паче будет контактировать с кислотой (электролитом) и сохранит свои свойства.